ACMG发布基因变异解读标准及指导原则

美国医学遗传学与基因组学学会（ACMG）联合分子病理学学会（AMP）发布了基因变异的解读标准及指导原则，发表在2015年5月的《Genetics in Medicine》上。对于那些想要确定患者的遗传变异是否与疾病相关的实验室和遗传学家而言，这是很好的指南和资源。

《标准》的主要内容

使用高通量测序检测孟德尔遗传病致病基因的时候，将序列中的变异分为五类：“致病的”、“可能致病的”、“致病性不明确的”、“可能良性的”、“良性的”

针对每一个序列变异，将已有的研究证据整合，将此变异进行分类

此标准仅适用于孟德尔遗传病致病基因的变异评价，不能用于复杂疾病和肿瘤。

每个变异的研究证据及证据分级

整合各种证据对变异进行分级

致病（pathogenic）变异的认定标准：

I. 1个PVS证据加上

a) ≥1个PS证据或

b) ≥2个PM证据或

c) 1个PM证据加上1个PP证据或

d) ≥2个PP证据

II. ≥2个PS证据或

III. 1个PS证据加上

a) ≥3个PM证据或

b) 2个PM加上≥2个PP证据或

c) 1个PM加上≥4个PP证据

可能致病（likely pathogenic）变异的认定标准：

I. 1个PVS证据加上1个PM证据或

II. 1个PS证据或加上1-2个PM证据或

III. 1个PS证据加上≥2个PP证据或

IV. ≥3个PM证据或

V. 2个PM证据加上≥2个PP证据或

VI. 1个PM证据加上≥4个PP证据

良性（benign）变异的认定标准：

I. 1个BA证据或

II. ≥2个BS证据

可能良性（likely benign）变异的认定标准：

I. 1个BS证据加上1个BP证据或

II. ≥2个BP证据

致病性不明确的（uncertain significance）变异认定标准：

I. 未满足上述的分级标准或

II. 良性证据与致病证据相互矛盾

参考文献

Standards and guidelines for the interpretation of sequence variants:a joint consensus recommendation of the American College of Medical Geneticsand Genomics and the Association for Molecular Pathology.